瑞安动车站建在马屿有以下原因：

首先，马屿是瑞安城市发展规划中的一个重要节点，交通便利，区位优越。瑞安动车站建在此处，可以极大地提高区域交通运输的效率。

其次，马屿长期以来一直是瑞安市的重要物流中心，附近拥有众多的工业园区和物流基地，这也使得瑞安动车站的建设在物流运输领域起到了积极推动作用。

最后，马屿也是瑞安市南部新兴的商业区域，未来有望成为瑞安地区新的经济增长点。因此，建立瑞安动车站不仅能够提高区域内的人流和货物流动效率，更能促进当地经济的快速发展。