如果按揭房已经拿到证但不办理抵押登记，可能会导致该房产存在二次抵押、司法查封、拍卖等风险。因为只有办理抵押登记，银行才能在权利人前受权享有抵押权，从而保证借款人按期还款。
若未及时办理，不仅会影响贷款人的资金流转和正常经营，还会给借款人带来严重的经济损失和风险。建议及时办理抵押登记，确保房产的安全
按揭房拿到不动产证后，通常需要将其交给银行保存。这是因为不动产证书是证明房屋所有权的法律文书，如果不妥善保存，会存在丢失或者损坏的风险。
此外，银行作为按揭贷款的放款方，需要确保其拥有的房屋产权得到有效保障，这也是银行要求借款人将不动产证交给他们的原因之一。
因此，借款人应该根据银行的规定来处理自己的不动产证，并遵守合同中的相关条款。