可以吃。一般来讲，洋葱存放时间过久，出现发芽长芽的情况时，营养成分会转移到发芽部分，只是会使洋葱的营养价值降低，不会产生有毒物质，因此，发芽的洋葱还是可以继续食用的，只是口感较差而已。
如果说洋葱芽已经长成青苗的样子了，那么可以将洋葱芽洗净后，炒食后食用；如果说洋葱芽还比较短，并没有完全长出来时，叶子部分会比较厚实，食用口感不是很好，不建议直接食用，但可以作为香辛料食用。
洋葱发芽后长出来的叫枝芽。
营养专家指出，采收的洋葱经干燥处理后，能贮存较长时间不会发芽或霉烂。但未经干燥处理或存放不当，也会发芽或腐烂，通常洋葱在15摄氏度左右最容易发芽。发了芽的乃至长出青苗的洋葱不会产生有害人体的物质，故仍可以吃。
但是，洋葱发芽后鳞块部分的营养物质会转移到顶部供芽生长，致使营养成分下降。另外，洋葱发芽后会影响其商品价值，其味也较辣。所以，应将洋葱置于阳光下晒一段时间，然后放在通风干燥处，尽量避免其发芽。
洋葱的茎在营养生长时期，茎短缩形成扁圆锥形的茎盘，茎盘下部为盘踵，茎盘上部环生圆圈筒形的叶鞘和枝芽，下面生长须根。成熟鳞茎的盘踵组织干缩硬化，能阻止水分进入鳞茎。
因此，盘踵可以控制根的过早生长或鳞茎过早萌发，生殖生长时期，植株经受低温和长日照条件，生长锥开始花芽分化，抽生花薹，花薹筒状，中空，中部膨大，有腊粉，顶端形成花序，能开花结实。顶球洋葱由于花期退化，在花苞中形成气生鳞茎。